来源:中国新闻周刊
原标题:奥密克戎重组*株XE闪现,我们应该担心什么?
它的平均传染率要比奥密克戎BA.2高大约9.8%
本刊记者/霍思伊
年的春天已经来到,但对很多人来说疫情的春天似乎还迟迟没有到来。
据美国约翰·霍普金斯大学新冠疫情数据,截至年4月6日,全球累计新冠确诊人数已经接近5亿人,死亡人数约为万。从增长曲线看,全球新增确诊病例在年1、2月间出现激增,且涨幅远高于前几轮的高峰期,一周累计新增确诊人数达到万。相比之下,年夏秋,当德尔塔变异株势头最猛时,一周新增的感染者最多也就是万。
全球新发病例数的剧增,与各国逐渐放开的防疫*策有关,但更重要的原因,是新一代*株奥密克戎的传播速度要快于德尔塔且隐匿性很强。更糟糕的是,奥密克戎自身也在不断进化,在很短的时间内,其亚种*株BA.2逐渐超过了原来的BA.1,成为很多地区的优势*株。目前正在上海流行的就是BA.2。
中国国家传染病医学中心主任、医院感染科主任张文宏指出,奥密克戎已经发展到第二代了,BA.2的R0值(基本传染数)可以达到9.5,这意味着一个人可以传10个人。这还意味着,现在病*的传播力几乎是早期传播力的3~5倍。据世卫组织的最新报告,当前,奥密克戎在全球占主导地位,在所有上传的*株基因序列中,奥密克戎占比达99.7%,其中,BA.2更是占所有测序病例的近86%。
与此同时,坏消息还在不断传来。最近,世卫组织又对奥密克戎的一种新变体XE发出了警告,这是一种由BA.1和BA.2重组而成的变体。该组织称,XE的传播力可能比BA.2还要高10%。
这是否意味着一种前所未有的“超强*株”出现了?疫情进入第三年,当新冠病*在不断地进行适应性进化,试图绕开人类的免疫屏障之时,我们又该如何科学而理性地应对?
新冠病*又现新变种XE,英国已有人确诊。(图片来源:中新视频截屏)
重组与突变有什么不同?
XE重组变体最早发现于英国,在年1月19日被首次检出,截至3月25日,英国累计发现例XE病例。根据英国卫生安全局(UKHSCA)3月25日发布的报告,一些早期数据显示XE的平均传染率要比BA.2高大约9.8%,这些病例分布在英格兰各地,以东英格兰、伦敦和东南英格兰地区为主,且数量不断增加。但报告也强调,由于已发现的XE病例数字太小,还无法按地区进行分析。UKHSA首席医疗顾问SusanHopkins也表示,到目前为止,还没有足够的证据得出关于XE传染力、致病性或疫苗有效性的相关结论,“也就是说,尚无法确认这种变体是否会成为真正的优势*株。”
目前,在英国占主导的优势*株还是奥密克戎BA.2,自2月以来,BA.2约占英格兰病例的93.7%,在东南部最流行,在当地的感染者中占比可达96.4%。
基因测序结果表明,XE的小部分基因片段来自于奥密克戎的原始*株BA.1,其余大部分来自BA.2,特别是病*与宿主结合的关键部位S蛋白的基因。因此,初步研究认为,从病*结构来看,其传播特性更接近BA.2,感染者症状也与BA.2类似。此外,XE还有三个BA.1和BA.2基因序列中不曾出现的突变。
对于重组变体,公众可能比较陌生。此前被世卫组织列为VOC(值得
但重组*株不同于突变*株。香港大学病*学家金冬雁对《中国新闻周刊》解释,重组*株诞生的条件“非常苛刻”,必须要有两种*株同时感染一个细胞,两种*株在细胞内都很活跃,才有可能重组。“这个概率本身是非常小的,因为哪怕两次感染的间隔时间稍微长一点,假设一个人先感染了BA.1,人体的免疫系统很快会产生抗体,等到感染BA.2时,BA.1可能已经被杀死了。”
德国华裔病*学家、埃森大学医学院病*研究所教授陆蒙吉也对《中国新闻周刊》解释,只有当感染新冠病*的人数达到一个“非常非常庞大的基数”之后,也就是到了奥密克戎在全世界大范围传播的阶段,才可能出现这种重组变体。过去,病*的传播力还没有这么强,一个人同时感染不同*株的概率也就比较小,而且这种重组不仅要形成一种可识别的稳定变体,还能感染下一个人。
世卫组织紧急卫生事件规划执行主任MikeRyan指出,病*传播得越多,变化的概率越大。“重组变体的可能一直摆在桌面上。”他说。
陆蒙吉认为,对于XE的理解,目前我们还知道得太少,一些初步的实验室数据也无法反应出它在真实世界中的传播能力,尤其是和BA.2相比有多大优势。在他看来,XE成为新的优势株的可能性“并不大”,因为它是组合了两种现有的奥密克戎亚型*株,“所谓突变也是原来的突变”,再过一段时间,当欧美大部分人已经感染了奥密克戎之后,也就产生了相应的抗体,XE再要突破和逃逸这种抗体是很难的,“相当于它是后发,其实没有优势。”
金冬雁也指出,XE可以说是BA.1和BA.2的“孪生兄弟”,是两个奥密克戎亚种杂交出来的,所以和两个亚种都很像。而奥密克戎能够成为全球的优势株,是在成百上千种突变株中自然选择的结果,XE只是它的一个子孙,“它的子子孙孙有没有可能比它强得多,可能性不会太高。”正如BA.2刚开始在欧洲流行时,法国卫生部长OlivierVéran曾理性地表示,这不会改变游戏规则。
世卫组织指出,在检测到XE重组变体在“传播和疾病特征(包括严重程度)上有显著差异”之前,它仍将被归类为奥密克戎变体的一种。
目前,英国除了发现XE之外,还监测到另外两种重组变体:XF和XD,它们都是德尔塔和BA.1的重组变体。其中,英国已发现了38例XF病例,但2月中旬以来就未发现任何新的病例。XD主要在法国传播,英国伦敦帝国理工学院病*学家TomPeacock指出,与XE相比,XD可能更令人担忧,它已在德国、荷兰和丹麦被发现,而且含有来自德尔塔的结构蛋白。“如果说这些重组变体中有哪一个的传播力与亲本*株有很大不同,它可能是XD。”他说。
当地时间4月12日,英国第三次全国性疫情封锁进入“解封”的第二阶段。(图片来源:中新网)
在陆蒙吉看来,从理论上来讲,与XE相比,奥密克戎和德尔塔的重组变体有更大的可能成为优势*株,因为当大部分人群都有对奥密克戎的抗体会后,如果一种新变体再将德尔塔组合进来,可能就会绕过人体因奥密克戎而形成的抗体反应。但他强调,目前,XF和XD的相关病例还很少,说明它们没有传播开来。事实上,仅凭病*的结构和基因序列,很难预测它在未来是否会成为优势*株。
他进一步解释说,预测一种新冠变体是否能成为一个优势株,是一个复杂的流行病学问题。随着新冠病*的继续传播,未来可能会出现越来越多的重组变体。很多时候,一个偶然事件的发生,就会影响整个疫情的走向,所以,要根据病*动态的传播情况来判断,比如在未来一段时间,奥密克戎在各国的传播到底会有多快、人群中产生抗体的情况是怎样的等。“我们可以通过监测不同新冠变体的基因片段来分析病*传播的历史,但我们往往很难预测未来。”
而对于奥密克戎亚种BA.1和BA.2的重组变体XE,陆蒙吉指出,至少要等待两周左右,才会有比较明确的答案。
病*进化的趋势是什么?
流行病学家和病*学家都知道,重组变体并不是个新鲜事。
UKHSA首席医疗顾问SusanHopkins教授在提醒人们
自新冠大流行以来,位于美国亚特兰大的Emory-UGA流感研究和监测卓越中心,就是该国监测新冠病*演化的一个重要哨点。来自该中心的多位流行病学家在研究了超过个基因组之后,发现其中只能检测到个包含重组证据的病*序列,仅占全部基因组的0.2%。经过模型估算,英国和美国最多只有5%的*株是重组变体,也就是说,在新冠病*的进化过程中,经过优胜劣汰而留下来的重组变体非常罕见,这一观察结果也解释了为何公众此前很少看到新冠病*重组变体的有关报道。
“新冠病*的重组和突变每时每刻都在发生。”金冬雁观察到,从疫情发生以来,曾有过成千上万个突变株,成百上千个重组*株,它们中的绝大部分都是昙花一现,悄无声息地消失了,而在真正经过自然筛选出来的VOC中,从阿尔法到奥密克戎,都是突变株,而不是重组*株,事实上,重组*株一个都没有留下来。“为什么会如此?因为重组变体都是近亲繁殖,所以其传播特性和亲本*株相比,不可能变化太大,也就是说,孙悟空根本跳不出如来佛的掌心。”
金冬雁指出,病*进化的方向一定是差异化,也就是通过获得一种与此前变体不同的“新的特性”,以绕过人类已经建立的免疫屏障,提高生存率和传播力,最典型的就是奥密克戎。
“也就是说,免疫原性出现了根本的变化。”陆蒙吉说,奥密克戎的典型特点就是有很强的突破感染力,换言之,以新冠原始*株作为模板而制成的疫苗,其产生的抗体对奥密克戎几乎不起作用。
如果把奥密克戎放入新冠病*的整个进化历史来看,可以更清晰地意识到它的特殊性。陆蒙吉解释,从最早的原始*株,到贝塔、伽马,一直到德尔塔,都可以算作同一种血清型,也就是从免疫学而不是基因的角度去给病*分类。同一个血清型意味着,这些不同变体所产生的抗体血清是一样的,所以疫苗对它们的有效性是接近的。但奥密克戎是另外一个血清型,从新冠病*的进化树来看,奥密克戎这一支和其他进化枝离得很远。
“事实上,现在我们也不清楚它的来源,它不是从德尔塔进化出来的。唯一知道的是,奥密克戎出现的非常突然。”
金冬雁表示,新冠病*的总体进化趋势,一定是向着传播力更强,但致病性更弱的方向进行。在人类和病*相互斗争的过程中,二者是在共同进化的,人类通过接种疫苗而不断获得抗体,病*为了生存则努力绕过抗体,适应性就会越来越强,“随着这种博弈的持续进行,总会出现一个新的优势变体*株取代奥密克戎,就像奥密克戎取代德尔塔一样,这是病*进化的自然规律,也是早晚的事。”
优势*株一般有何特点?陆蒙吉指出,它可以逃逸部分人体的免疫应答,尤其是抗体逃逸,而且一定有更强的传播力。此外,从近期的几个优势*株的进化来看,它越来越接近上呼吸道感染,能够在此处产生大量的病*通过呼吸散播出去,从而造成更大概率的气溶胶传播。总体来看,免疫逃逸性、传播模式和感染部位,这三个组合起来,对新冠病*的适应性生存非常重要。
日本民众戴着口罩走过东京一座火车站的大厅。(图片来源:中新网)
重要的是加强基因组监测
对人类而言,及时掌握病*的进化趋势非常重要。但如果难以准确预测优势*株何时会出现,人类又能做些什么?
重组变体的出现在某种意义上为我们敲醒了警钟。世卫组织流感病*分子诊断工作小组专家、香港大学公卫学院教授潘烈文等人研究了今年2月在赴港旅客中检测到的BA.1与BA.2的重组变体,这不是XE,而是一种新的变体,但只在两个病例中被发现,没有形成社区传播。潘烈文指出,尽管目前的全球监测数据表明重组变体可能只有零星的案例,但仍不应低估这种重组的潜在影响。应该注意的是,同源重组在动物和其他人类冠状病*中非常常见,并且其中一些重组事件可以产生具有更强致病性的*株,这迫切需要在全球范围内对新冠病*进行长期的基因组监测。
陆蒙吉也指出,虽然无需对XE的出现过于恐慌,但仍要对它的基因序列保持持续的监测,对其他重组*株和突变株也要如此。这次在英国最早发现XE,并不代表它的源头就在英国,很可能只是因为英国拥有全球最强大的病*变异监测系统,因此可以更及时地将它识别出来。更早之前,英国也是全球首个发现新冠变体阿尔法(B.1.1.7)的国家。
为了能对新冠病*样本进行大规模和快速的全基因组测序,以更快识别出新的变体,英国在年4月成立了Covid-19基因组学联盟(COG-UK),*府投入了万英镑,汇集了该国四大公共卫生机构、多个地区性大学分子生物学中心和大型的测序中心。年初,英国又成立了G2P-UK国家病*学联盟,与COG-UK合作,专门研究新变体是否会传播得更快、导致更严重的疾病,以及影响疫苗的有效性。
G2P-UK的联合负责人之一、伦敦国王学院传染病学教授MichaelMalim在接受媒体采访时说,一旦确定了某一种新变体是值得
这就是监测系统的现实意义之所在——通过监测以实现对新冠疫情的快速反应,并为疫苗的及时更新提供决策支撑。根据全球新冠基因序列共享数据库GISAID和GenBank,截至年1月14日,英国一共测序了超过15万个病*样本,几乎是全球所有国家测序的一半,在英国内部,这相当于约10%的阳性病例覆盖率。有研究表明,在其他国家,阳性病例的基因测序率大约在1%~5%之间。具体而言,不同国家之间的差异很大。比如美国,在病*变异的监测方面,在世界范围内只能排在第43位。
PhillipFebbo是美国企业Illumina的首席医疗官,这家企业以其领先的基因测序技术而知名。Febbo在一项研究中用模型估算发现,定期对社区中的阳性病例按5%的比例进行基因抽检,可以有效识别出流行率为0.1%~1%的新变种,“正如我们在英国看到的那样,一旦变体的流行率超过1%,就几乎没有遏制的机会了。”他这样写道。
专家指出,英国的经验值得在各国推广,尤其是它的阳性病例基因组抽检机制。在陆蒙吉看来,系统性的监测机制的建设,不是一天、两天就可以完成的,需要一个过程,还需要足够的实验室、高通量基因测序设备、受过专业培训的人员和资金,以及相应的规章制度和上下打通的数据库。现在,很多国家已经放松了防疫*策,病*和人群之间的互动也变得更加频繁和复杂,共同进化也会加速,在这个过程中,基因组监测将成为不可或缺的一部分。
目前,世卫组织已将基因组监测视为全球防疫的优先事项,并且呼吁各国继续加强病*监测能力。但随着全球多国重新开放,解除防疫措施,对病*的基因检测变得越来越匮乏,世卫组织对这个现象表示了担忧,警告此类做法不可取。“数据正变得越来越缺乏代表性、越来越不及时、越来越不可靠。这抑制了我们追踪病*在哪里、如何传播以及如何演变的能力。信息与分析对于有效结束疫情紧急阶段仍然至关重要。”世卫组织总干事谭德塞说。
老年人是中国防疫最主要的短板
面对越来越狡猾的病*,专家指出,下一阶段各国的防疫重点已经很明确:尽快给老年人和有免疫缺陷的高危人群接种加强针。3月30日,世卫组织发布了结束全球新冠紧急状态的最新计划《战略预备、准备和响应计划》。该计划中最重要的一点,就是呼吁各国要继续推进疫苗接种。
金冬雁推测,由于感染的条件很苛刻,重组变体大概率可能诞生于未接种疫苗的人体内,“如果你打过了疫苗,感染了第一种*株后,很快就产生很多抗体,至少不会在短期内立刻感染第二种同源*株。”他解释道。
专家指出,对中国来说,最大的短板就是老年人接种障碍。3月18日,在国务院举行的疫情防控新闻会上,有媒体提问:“中国在80岁及以上的人群中,有多少人接种过一针、两针或第三针疫苗?”国家卫健委副主任曾益新回答:“这个问题非常关键、非常重要。”
据曾益新介绍,截至3月17日,80岁以上的老年人群中,完成全程接种的比例只有50.7%,完成加强免疫的才19.7%,这个比例还是比较低的。而中国60岁以上共有2.64亿人口,其中还有万(约20%)60岁以上的老年人没有完成全程接种。
早在年11月底,中国没有完成全程接种的老年人数字就是0万左右,相当于一个中等规模国家的人口数量。在去年11月30日的国务院联防联控新闻发布会上,国家卫健委科技发展中心主任郑忠伟对此发出了警告,他表示,如果不快速推动这0万人群的疫苗接种工作,一旦放松管控,将出现重症、死亡情况,造成重大的社会问题。
曾益新在3月18日的发布会上指出,老年人本身的免疫功能就相对于年轻人要弱一些,而且大多有各种基础疾病,一旦感染新冠病*,发生重症和死亡的风险远远高于年轻人。在他看来,扬州疫情和香港疫情是两个典型的教训。年8月的扬州疫情,总共有例感染者,因为老年人多,所以重症的出现率也比较高,60岁以上的老人里出现了67例重症,其中65例是没有接种或者没有完成全程接种的。而在近期的香港疫情中,接种疫苗者的病亡率是0.04%,没有接种或没有全程接种的病亡率是1.25%,有几十倍的差距,并且香港这次疫情中,病亡者中90%都是老年人。“从这两个例子可以得出两个结论:疫苗接种对于预防重症、预防死亡有很好的保护作用。此外,老年人和有基础疾病的人群,是最需要保护的,也是最需要接种疫苗的。”他说。
郑忠伟也提醒,部分省市80岁以上老年人群接种率不足30%,70岁以上老年人群接种率不足50%。很多老年人以为待在家里或处在偏远的农村,感染风险就降低了,这是误解。随着年轻人接种疫苗比例越来越高,他们如果感染将呈现轻症或无症状。在逢年过节和老人团聚时,完全可能存在把病*带回家感染老人的风险。因此,一定要做到所有老人应接尽接。
金冬雁指出,老年人接种疫苗后,体内的抗体容易衰减,因此,未来应该经常对这些最脆弱的人群进行抗体检测,“当他们体内的抗体弱了,就应再补打一针。”