先心病治疗

注册

 

发新话题 回复该主题

快速WES用于胎儿多种先天性畸形诊断的前 [复制链接]

1#
白癜风一个疗程多少钱 https://m-mip.39.net/baidianfeng/mipso_4513569.html
在荷兰北部地区,2%-3%的儿童发生先天性畸形,孕中期超声可发现先天性畸形,并发现约1%的胎儿结构异常。由于许多原因,寻找超声异常的潜在病因是非常重要的。短期来看,它可以提供疾病预后信息,使父母作出更好的知情选择继续或终止妊娠。中期来看,明确诊断可以帮助产科医师确定最佳的产科管理(例如,分娩方式),并帮助新生儿科医师优化新生儿护理。长期来看,识别超声异常的潜在遗传原因对于确定复发风险至关重要。目前的遗传诊断检测只能检测染色体数目异常、拷贝数变异和单亲二体。这些检测揭示了约40%的超声异常病例的潜在原因。然而,这意味着约60%的病例在怀孕期间仍未得到诊断,其中一部分可能是由单核苷酸变异或微小插入缺失引起的单基因疾病。在产前,外显子组测序(WES)是检测单基因原因的一个有前途的工具。在标准诊断程序中加入快速WES(rWES)可以额外发现6%到80%的原因,在有多个先天性异常或临床怀疑综合症的胎儿中有更高的检出率。然而,尽管WES可能提高诊断率,但由于胎儿表型的不确定性、伦理咨询问题、变异解释的困难、临床意义未知的变异是否需要报告以及需要短的周转时间,实施产前WES具有挑战性。这项前瞻性队列研究于年3月至年1月在荷兰格罗宁根的UMCG的遗传学和产前诊断部门以及荷兰兹沃勒的ISALA医院的产科进行。rWES胎儿的纳入标准为:(a)两个或两个以上独立的主要胎儿畸形,(b)胎儿水肿或单独的双侧肾囊肿,或(c)一个主要胎儿畸形和至少一个具有相同异常的一级亲属。纳入后,患者接受常规产前诊断,从QF-PCR开始,检测13、18和21三体、X单体和三倍体。在正常的QF-PCR结果之后,并行启动基因芯片和rWES。详细流程如下图根据基于ACMG变异解读标准化指南,对可能解释胎儿表型的所有变异和所有未经请求的发现进行分类,同时考虑到人类基因突变数据库(HGMD)、CADD评分和群体频率。只将分类为致病性和可能致病性的变异传达给父母,不报告临床意义不明的变异(VUS)。结果在符合纳入标准的55例侵入性手术中,28例被排除在外。排除的主要原因是QF-PCR异常(n=18)。共有27例患者接受了SNP基因芯片和rWES的检测,rWES最常见的指征是大脑、心脏和骨胳的主要异常和/或水肿。6例胎儿有一个一级亲属伴有与胎儿异常相关的先天性异常。在其中四个病例中,一级亲属的先天性异常是符合本研究纳入标准所必需的。在24例病例中,rWES与SNP基因芯片同时检测,另外3例是在SNP基因芯片检测后要求rWES,因为在初次超声后发现其他异常时,表型发生了变化。在这项研究中包括的55个胎儿中,35个(64%)获得了明确的基因诊断。在28个胎儿中,没有进行rWES。其中18例是由于QF-PCR异常所致。在其他10个胎儿中,由于各种其他原因没有进行rWES检测,但5个胎儿获得了基因诊断。在正常QF-PCR结果后纳入的27例rWES联合SNP基因芯片检测的胎儿中,12例(44%)获得了基因诊断,其中4例通过SNP基因芯片确诊,8例通过rWES确诊(6例为新发突变,2例为隐性)。结果对怀孕的影响12例有明确遗传诊断的妊娠中有10例终止妊娠。在会诊期间与患者的交谈表明,5例患者的遗传检测结果在决定终止妊娠的过程中起着关键作用。在另外两个阳性案例中,遗传诊断的严重程度支持父母选择在出生后实行产科无隔离*策和舒适护理。在其余15例未获得明确基因诊断的妊娠中,由于没有发现明显的致病变异,至少有4对夫妇决定继续妊娠。在两个病例中,结果对于围绕积极的产科和新生儿管理的决策是重要的。在15例未获得明确基因诊断的病例中,有14例获得妊娠结局数据。根据超声异常的严重程度终止了7例妊娠。其中一例在妊娠13周左右流产。妊娠第21周和第32周有2例发生宫内死亡。四个孩子生下来还活着。讨论在超声上识别胎儿的表型是具有挑战性的。超声图像是胎儿解剖结构的数字表示,并且不是每个异常都能被超声检测到,畸形特征特别难以识别。关于表型的详细信息对于遗传数据的准确解释仍然是必要的。对胎儿表型的不确定性和对胎儿表型与致病基因有关的知识的缺乏是可能的,但不可避免的,这阻碍了对数据的正确解释。另一方面,可疑的诊断可能被证明是错误的。产前WES可对父母的决策、分娩和围产期管理产生重大影响。在我们的研究中,分子诊断是5例终止妊娠的决定性因素。然而,同样重要的是要认识到,在至少四个病例中,没有检测到明显的致病变异的结果支持父母继续怀孕的决定。总之,我们的研究清楚地表明,与目前超声异常胎儿的QF-PCR和SNP基因芯片相比,rWES可提供额外的阳性诊断率。在64%的病例中确定了潜在的遗传原因,18%是通过rWES确定的。尽管rWES的诊断率很高,但在产前背景下,rWES仍然具有挑战性,特别是在所需的周转时间短、产前表型和变异分类的不确定性以及不可避免的意外发现方面。基因游侠

让更多人了解基因干货!

分享 转发
TOP
发新话题 回复该主题